巩留核桃已有上百年的种植历史。
1983年，巩留县在东买里乡境内建立了野生核桃自然保护区。
1984年12月，新疆林业厅在乌鲁木齐市召开了巩留雪岭云杉自然保护区、甘家湖梭梭林自然保护区、巩留野核桃林自然保护区、伊宁小叶白蜡自然保护区科学考察评审会，来自西北大学、中国科学院新疆分院生土所、自治区科委、新疆林业勘察设计院、新疆八一农学院、新疆大学、新疆农科院、伊犁地区林科所、自治区林校、伊犁州、乌苏县及托里县林业局、精河及乌苏甘家湖梭梭自然保护区管理站等单位的40多名专家、教授和科技人员,审查了这几个自然保护区的科学考察报告、图片及植物标本。
2011年，巩留核桃保护面积2667公顷，年总产量达到1800吨。
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