石硖龙眼原种出自平南县大新镇,种植始于民国十六年(1927年),由早年留学日本早稻田大学的大新镇乡绅覃敬清先生种植,2013年存留老树108株,具有很高的生产和品种资源保存价值,是全国唯一的石硖龙眼母本园,广西大部分的石硖龙眼直接或间接来源于这些老树,现已成为旅游景点。
平南县石硖龙眼的快速发展是从1990年开始,2004年建成了广西第一个龙眼出口基地,广西最大的龙眼加工厂,是全国面积最大的石硖龙眼生产基地。平南石硖龙眼优良的品质、独特的种植和人文历史,吸引了各种媒体的报道,成为中央电视台纪录片《秘境广西》和《美丽西江》的拍摄题材。
2014年5月22日,原中华人民共和国农业部批准对“平南石硖龙眼”实施国家农产品地理标志登记保护。
2018年,平南县石硖龙眼产量达20万吨以上,产值约13亿元。
2019年11月15日,入选中国农业品牌目录。