舟山晚稻杨梅栽培历史悠久,早在元大德二年(1298年)《大德昌国州图志》中就有明确记载:“舟山果树有杨梅、樱桃、梅等20种,而杨梅为各水果之首”。舟山晚稻杨梅种植区域内仍有百年树龄的晚稻杨梅栽培树群近百亩,其中一株树龄已高达150年。
皋泄晚稻杨梅原产爱国村泄岭下,相传有700余年历史。循史查考,到爱国村杨嘉发老人(逝于清光绪十三年)时,晚稻杨梅完成变异进化,成为海岛水果之独特珍品。1950年前,这一“佛国仙果”,却一直是“新居未换一根椽,只有杨梅不值钱”的山中野果,栽培仅局限于皋泄乡的几个村庄,面积不到500亩。
舟山晚稻杨梅为中国四大著名杨梅品种之一,在20世纪90年代初通过了浙江省杨梅品种认定,且在认定时延用了民间的晚稻杨梅称谓,被《中国杨梅志》编写会议评为继荸荠种杨梅后又一制罐良种。晚稻杨梅的命名充分体现了舟山的语言特色,与晚稻杨梅在舟山长期的种植历史渊源深厚相关。
20世纪90年代开始,由于经济效益凸显,晚稻杨梅被列为舟山市定海区骨干农产品和主导产业之一。
1998年到2002年间,定海区政府先后出台扶持政策,以补助或贴息贷款的方式对杨梅规模种植户给予支持,晚稻杨梅产业进入快速发展期。
2010年12月24日,中华人民共和国农业部批准对“舟山晚稻杨梅”实施农产品地理标志登记保护。
2018年,舟山晚稻杨梅主产区定海区种植杨梅面积约4.65万亩,其中晚稻杨梅占到近4万亩。