1500多年前,南北朝刘敬业在《异苑》中记载:“南康有奚石山,有柑橘、橙、柚。”南康就是今天赣州一带。至北宋年间,柑、橘、橙、柚等果树已经蔚然成林。在清朝年间,赣南脐橙是下方官员进贡给朝廷的水果之一,深得雍正帝喜食。
1971年,信丰县安西园艺场从湖南邵阳引种156棵“华盛顿脐橙”,三年后开始结果并参展“广交会”,得到了外贸界、香港商界的高度评价,在香港试销价格为每公斤36港元,高于美国产脐橙。
20世纪80年代,中国科学院南方山区综合考察队在赣南实地考察一年后得出这样的结论:“赣南发展柑橘气候得天独厚,应成为我国柑橘商品生产重要基地。”时任中共中央总书记的的胡耀邦专门为发展赣南柑橘产业作出批示。赣州从华中农业大学引种纽贺尔等8个脐橙品种试种成功。
1990年11月,赣州科技部门组织专家对项目进行验收和成果鉴定,现场测产达到亩产2964.18公斤,为当时国内同类研究的最好成绩。
2000年11月24-29日,农业部种植业管理司经作处副处长王小兵,华中农大柑桔研究所所长孙中海教授,中国农科院柑桔研究所所长助理邓烈副研究员来赣南考察脐橙生产后,提出“赣南:加入WTO之后中国柑桔的希望所在”的考察报告。
2002年以后,赣州市新开发种植的脐橙面积以年均近20万亩的速度迅速扩张。
2003年2月12日,农业部正式发布《优势农产品区域布局规划(2003—2007年)》,将赣南列入赣南湘南桂北优势产业区,将成为我国重要的鲜食脐橙生产基地。同年被批准为中国国家地理标志保护产品。
2012年11月-12月,第四届中国赣州国际脐橙节在赣州举行,由农业部、江西省人民政府主办,赣州市人民政府、江西省农业厅承办,主题是“相约世界橙乡·共促赣南苏区振兴”。同年,赣南脐橙种植总面积达183万亩,总产量达150万吨,全市实现脐橙产业集群总产值80亿元,其中鲜果收入40亿元,帮助25万种植户、70万果农增收致富;果农人均脐橙收入5800元,占果农人均收入的80%,脐橙收入占全市农民人均纯收入的12%。
2014年,赣南地区赣州市脐橙种植面积世界第一、年产量世界第三,赣南脐橙产量预计120万吨左右,占全球脐橙产量的15%;除国内市场外,还将远销东南亚、俄罗斯、北美等20多个国家和地区。
2016年,赣南脐橙品牌价值达到668.11亿元,连续四年位居全国初级农产品类地理标志产品价值榜榜首。
2017年,赣州市脐橙种植面积达155万亩,占世界的17.2%,全国的44.7%;产量108万吨,占世界的11.3%、全国的39.6%。种植面积、年产量居全国第一。同年,赣南脐橙列入中欧“100+100”互认保护名单。